口袋奇兵的元素研究系统分为五个主要级别，每个级别对应不同的属性加成和技能解锁条件。该系统通过升级材料逐步强化，最终影响全军的战斗表现，包括攻击、增伤、减伤等核心属性。玩家需合理分配资源，并根据不同兵种需求调整元素搭配，以最大化战斗收益。
元素研究的第一级至第三级为基础阶段，主要提升基础攻击属性。第一级解锁基础攻击加成，适用于所有兵种；第二级强化每次攻击的伤害值，但需注意该阶段不包含增伤或减伤效果；第三级为核心转折点，提供增伤、减伤等高级属性，但解锁条件较为严格，需要对应第二排技能达到10级。这一阶段通常需要长期积累资源，非付费玩家需耐心规划升级路径。
第四级和第五级为进阶阶段，侧重战术性属性调整。第四级开放元素切换功能，允许玩家为陆、海、空三军分别配置穿透、电浆、爆炸等特效；第五级则进一步优化属性比例，例如陆军可专注攻击加成，海军选择生命提升，空军侧重增伤效果。高级别的元素搭配需结合英雄属性和战斗场景，例如PVP优先选择高速开火和减伤组合，而BOSS战则需强化暴击和命中。
资源获取与优先级是升级的关键限制因素。元素反应堆零件为通用升级材料，可通过海岛商店兑换，但每日获取次数有限。老玩家可利用旧海岛机制卡时间兑换，而新玩家需按部就班积累。建议优先提升主力兵种对应的元素属性，例如陆军玩家集中升级穿透元素，避免资源分散导致战力成长滞后。
