前往游戏中的海上船只，玩家首先需要明确目标船只的类型与位置，并为此做好相应的前置准备。最常见的海上船只包括璃月港外的珠钿舫，以及分布在各海域的浪船。前往珠钿舫最便捷的方法是找到璃月港海边小船上的NPC平海进行对话传送，但这通常要求玩家此前已通过其他方式登船一次以解锁该NPC。若为首次前往，则需依靠角色能力，例如从璃月港的高处利用风之翼滑翔至船上，或在体力充足的情况下，借助凯亚、神里绫华等冰系角色连续使用元素战技冻结水面，通过凝冰的方式渡海抵达。
若需驾驶浪船出海探索，玩家需先找到浪船锚点。在稻妻区域或金苹果群岛等地，地图上会显示浪船锚点图标，靠近后点击召唤浪船即可获取船只。召唤后，靠近浪船点击驾驶浪船便可操控其航行。这是探索广大海域，前往如清籁岛、海祇岛等岛屿的核心交通方式。需部分浪船锚点或海域的解锁存在前提条件，例如前往稻妻清籁岛需冒险等阶达到30级并完成相应主线任务，否则航行会受屏障阻挡。
对于稻妻地区某些特定的大型船只，如北斗的死兆星号，其登船方式与主线任务紧密绑定。玩家需要完成起航之日等特定任务线，在剧情指引下于璃月港指定海域找到船只并触发登船动画，才能正式乘船前往稻妻。这是一种剧情强制的进入方式，无法自由前往。游戏内存在一些与船只相关的世界任务，例如孤帆幽影，这类任务通常有独立的触发点，需要玩家在特定地点与NPC对话接取，并跟随任务流程调查线索、追逐幻影，最终才能接触到任务目标船只并完成任务获取奖励。
玩家需要掌握基本的操作与资源管理。驾驶时，通过方向键或鼠标控制航行方向，并留意屏幕上的技能按钮，普通攻击、重击、冲刺和下船等操作均有对应按键。航行会持续消耗体力，当体力耗尽时船只会无法冲刺，玩家需停驶一段时间待体力自动恢复。在长途航行或前往被雷暴等环境效果影响的区域（如清籁岛周边）时，建议提前做好规划，可考虑携带提升雷元素抗性的角色或装备以减少伤害。
探索海上船只本身也是游戏体验的一部分。许多船只上设置有宝箱、神瞳（如岩神瞳）、世界任务或可对话的NPC。例如在珠钿舫上，玩家在首次抵达后可以接取海上盛珠钿等任务，通过与船上的秋歌、落霞等NPC交谈来推进剧情，并获得永久传送的便利。登船后进行全面探索并与所有交互点互动，是获取完整奖励与游戏内容的关键。
